Zur Bearbeitung von anstehenden Fragestellungen sowie für die Erledigung mittel- und längerfristig wahrzunehmender Aufgaben hat die DGAI Kommissionen und wissenschaftliche Arbeitskreise eingesetzt. Hierzu haben das Engere und das Erweiterte Präsidium der DGAI eine gemeinsame Geschäftsordnung für die Einsetzung von Kommissionen, wissenschaftlichen Arbeitskreisen, eines Präsidentenbeirates und Beauftragten erarbeitet. Die Mitglieder der Ad-hoc-Kommissionen und permanenten Kommissionen werden von den Präsidien bestimmt.